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国家：日本
KEGG数据库1995年由Kanehisa实验室建立于日本京都大学生物信息学中心， 主要目标是通过基因组信息实现包括细胞、 生物和生态系统在内的生物系统的信息化重建， 将来源于已发表文献中的实验数据以分子相互作用和反应网络用可视化的形式展现出来， 尝试将特定生物种群中观察到的实验证据推广到另一生物种群中。
1995年，KEGG最初是作为一个集成的数据库资源而开发的，通过KEGG通路图谱对完全测序的基因组进行生物学解释，即把基因组中的基因映射到人工创建的通路图上的程序。最初，KEGG仅由PATHWAY、GENES、COMPOUND和ENZYME四个数据库组成，KEGG路径图绘制是通过ENZYME进行的，因为该数据库只包含代谢路径图。后来对KEGG进行了大幅扩充，PATHWAY补充了BRITE和MODULE，GENES扩充了GENOME，COMPOUND补充了GLYCAN和REACTION，ENZYME则用KO代替了KEGG途径图谱的作用。KEGG的应用也越来越广泛，不仅可以分析基因组学数据，还可以分析转录组学、蛋白质组学、糖组学、代谢组学、宏基因组学等高通量数据。
KEGG是一个高度整合的数据库。实际上，KEGG数据库可以看做是利用计算机对生物系统进行模拟，生物学的对象以及他们在分子、细胞和生物体水平上的关系都被计算成一个独立的数据库记录。每个数据记录都成为KEGG对象。除了基因和酶使用标准的命名（基因命名使用locus_tags、酶使用EC命名）外，每种数据对象都有一个标识符。KEGG对象命名原则为一个5位数的号码加一或两个大写字母作为前缀。
